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-aI253
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-atRp52
-s.
\ No newline at end of file
diff --git a/geneExpressionData/AtlasViewerFormat/README.md b/geneExpressionData/AtlasViewerFormat/README.md
deleted file mode 100644
index 4215ffcaf0004e34b6f7f6ab23db6be38716ca0e..0000000000000000000000000000000000000000
--- a/geneExpressionData/AtlasViewerFormat/README.md
+++ /dev/null
@@ -1,23 +0,0 @@
-## Gene expression data in AtlasViewer format
-
-Each folder contains gene expression data in AtlasViewer format for a specific 
-layer (L1, L2, L1&L2) and all cells.
-
-To visualise patterns, first run AtlasViewer via atlasviewer/launch_aviewer.py. 
-Drag and drop the segmentation file and the visualization widget and then drag 
-and drop the pattern file. Select the genes to visualize form the right pane and
-click "Atlas gene expression" button from the AtlasViewer menu.
-
-To read the .pat files in the folders:
-
-import cPickle
-
- fobj = file("patternFileName.pat")
- 
- patterns = cPickle.load(fobj)
- 
- fobj.close()
- 
- 
- #patterns is a Python dictionary whose keys are genes and values are cell 
- labels expressing the gene.
\ No newline at end of file
diff --git a/geneExpressionData/AtlasViewerFormat/allcells/.gitkeep b/geneExpressionData/AtlasViewerFormat/allcells/.gitkeep
deleted file mode 100644
index e69de29bb2d1d6434b8b29ae775ad8c2e48c5391..0000000000000000000000000000000000000000
diff --git a/geneExpressionData/AtlasViewerFormat/allcells/patterns_10h.pat b/geneExpressionData/AtlasViewerFormat/allcells/patterns_10h.pat
deleted file mode 100644
index 3ee2a2f4995510f31381068a270fb653ffbb36e0..0000000000000000000000000000000000000000
--- a/geneExpressionData/AtlasViewerFormat/allcells/patterns_10h.pat
+++ /dev/null
@@ -1,1908 +0,0 @@
-(dp1
-S'CUC1'
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